分會
第三十九分會:生物物理化學(xué)
摘要
甲型H9N2亞型流感病毒是一種禽流感病毒,長期以來已在世界范圍的家禽業(yè)中傳播,偶爾發(fā)現(xiàn)它可以傳播給人類。基因組分析的證據(jù)表明,H9N2具有H5N1和H7N9亞型的基因,而這些基因已發(fā)現(xiàn)會導(dǎo)致病毒感染哺乳動物并威脅人類健康。然而,由于缺乏H9N2與宿主細(xì)胞之間相互作用的結(jié)構(gòu)模型,因此對H9N2的廣泛適應(yīng)性和強(qiáng)大轉(zhuǎn)化能力的機(jī)制尚不完全清楚。在本文中,我們收集了40個主要分布在中國和周邊國家最近報(bào)道的代表性H9N2病毒樣品,使用分子對接模擬技術(shù)在原子水平上研究了H9N2血凝素與哺乳動物受體多糖人受體類似物L(fēng)STc (α2-6-lactoseries tetrasaccharide c)的相互作用。我們根據(jù)H9N2血凝素對配體結(jié)合相互作用及其系統(tǒng)發(fā)生樹關(guān)系,對突變進(jìn)行了聚類分析。計(jì)算表明,所研究的H9N2病毒均可以與LSTc建立緊密結(jié)合,突變可以引起結(jié)合袋局部構(gòu)象的多種擾動:最終在保守的配體-受體相互作用與結(jié)合口袋的構(gòu)象動力學(xué)之間建立了邊緣平衡,可能正是這種平衡使得病毒能夠適應(yīng)各種環(huán)境。我們的結(jié)果為研究H9N2病毒的適應(yīng)機(jī)制提供了一種簡化途徑,它將有助于預(yù)測H9N2病毒在哺乳動物中的傳播傾向。
關(guān)鍵詞
H9N2;血凝素A;LSTc;Vina對接;邊際接觸平衡
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